La première grande traversée des Pyrénées
C'est en 1806 qu'il reçoit pour mission par le Ministre de l'Intérieur Champagny (sousNapoléon Bonaparte), de parcourir la France pour étudier la botanique et c'est en 1807 qu'il effectue la première grande traversée des Pyrénées d'Est en Ouest.
Un périple minutieusement consigné dans son carnet de route "Voyage de Tarbes" .
Si de Candolle a marqué l'histoire de la botanique, il a aussi laissé une trace digne des grands explorateurs dans la conquête des Pyrénées comme Russel, Ramond…
A.P. de Candolle fut le seul à avoir traversé en une seule fois la chaîne des Pyrénées en passant par les plus hauts sommets comme le Pic de la Maladetta 3187m…)et en y réalisant de très nombreuses ascensions, en seulement 2 mois.
Animé à la fois par ses recherches et sa soif de découvertes de Candolle laissera aussi ses traces dans la littérature car il domine l'ensemble des ouvrages publiés de la fin du XVIII et le premier tiers du XIX sur les Pyrénées à l'identique notamment de Palassou, Ramond, Dralet ou Jean de Carpentier.